La construction du schéma conceptuel constitue l’étape préliminaire indispensable à toute démarche de gestion. S’agissant de la démarche d’interprétation de l’état des milieux (IEM), le schéma conceptuel s’attache à caractériser l’état des différents milieux d’exposition qui sont susceptibles de poser problème au regard de leurs usages constatés. S’agissant du plan de gestion, il évolue de manière itérative d’une configuration initiale, qui consiste à caractériser l’état du site et des milieux concernés par le projet de réaménagement, vers la représentation du projet dans sa configuration finale.
La constitution du schéma conceptuel doit permettre d’appréhender l’état des pollutions des milieux et les modes de contamination potentiels au regard des activités et des usages qui existent sur le site étudié et dans son environnement comme l’indique l'exemple ci-après.

Il est constant, à ce stade, de souligner l’importance des diagnostics de terrain qui doivent permettre de connaître l’état de pollution des milieux. Le retour d’expériences amène en effet trop souvent à constater que des crises naissent sur la base de diagnostics insuffisants. Ces diagnostics doivent par conséquent être vus comme un investissement qui permettra de faire les choix les plus judicieux en matière de gestion.
Dans un second temps, au regard des résultats présentés par le schéma conceptuel et des propositions dans le cade du plan de gestion, on avise alors des éventuels études et diagnostics complémentaires qui s’avèrent nécessaires ainsi que des mesures de gestion à mettre en œuvre, après une éventuelle discussion entre aménageur/promoteur, l’exploitant, le propriétaire et l’inspection des installations classées.